nCounter Service

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nCounter 서비스

Faster than qPCR, Simpler than NGS

nCounter® 플랫폼은 single tube에서 최대 800개의
RNA, DNA 또는 protein의 multiplex 분석이 가능하며, 간단하고 비용면에서도
효율적인 솔루션을 제공합니다.

유전자의 증폭, cDNA 합성 또는 library prep 과정을 필요로 하지 않아,
효소작용에 의한 오류가 없습니다.

Codeset 과 RNA 샘플 준비 완료 후, 실험 및 분석은 7일 이내에 종료됩니다.

Digital count for gene expression

nanoString사의 특허인 형광 바코드는 진정한 디지털 검출 기술로서, High multiplexed analysis가 가능합니다.

nCounter Analysis System은 target 특이적으로 디자인된 100mer의 probe를 이용하여 target 유전자를 detection 합니다. 100mer의 oligo end에는 각각 바이오틴과 형광 바코드가 부착되어 있습니다.

- Reporter probe는 target 특이적인 형광 바코드가 부착되어 있습니다. 4종류의 형광 dyes 를 길게 늘어트려 바코드마다 특이적인 형광 신호를 발할 수 있도록 제작이 되며, 최대 800개의 유전자에 대해 특이적인 신호를 형성할 수 있도록 제작 됩니다.

- Total RNA 혹은 genomic DNA에 target 유전자가 포함되어 있을 경우, 아래와 같이 hybridization 되며, 형광 바코드에서 생성되는 특이적인 형광 신호를 detection 한 후, 동일 형광 바코드 신호를 count 하여 유전자의 발현 정도를 정량 할 수 있습니다.

- 유전자의 발현량은 count number로 표시가 되며, 샘플 내에서 유전자의 발현 정도 및 샘플 간의 발현 정도를 비교할 수 있습니다.

Insight from Difficult Samples

nCounter 시스템은 total RNA부터 세포 자체, 혈액 용해물 및 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE)와 같은 샘플까지 흔들리지 않는 정밀도로 분석이 가능합니다.
심하게 단편화 된 RNA도 실험 적용이 가능합니다.

Formalin-Fixed paraffin-embedded tissue

“… the probe-based NanoString method achieved superior gene expression quantification results when compared to RQ-PCR in archived FFPE samples. We believe that this newly developed technique is optimal for large-scale validation studies using total RNA isolated from archived, FFPE samples.”

Crude Cell Lysates

Three cell lysates (2,500, 5,000, and 10,000 cells) were compared to 100 ng of purified total RNA. Results using cell lysates were highly correlated with purified RNA (R2 > 0.97 for all three) and demonstrated that comparable data can be achieved with either protocol.

Whole Blood Lysates

Two PAXgene™ - lysed whole blood replicates compared to 100ng of matched purified total RNA. Results using blood lysates were highly correlated with purified RNA ( R2 > 0.96 and R2 > 0.97) and demonstrated that high quality data can be obtained using PAXgene-lysed whole blood. (PAXgene is a trademark of QIAGEN®.

Service ordering is Easy!

1. SELECT YOUR GENE PANEL

Choose from one of the predesigned panels or design your own

2. TELL US ABOUT YOUR SAMPLES

Sample type (isolated RNA, FFPE, blood, etc)

Number of samples

Species

3. CHOOSE YOUR DATA ANALYSIS PACKAGE

Raw and normalized data is included in your NanoString run; or you can select our premium Interactive Data Analysis Package

Why Choose PhileKorea’s nanoString Service?

㈜필코리아테크놀로지의 나노스트링 실험대행 서비스는 다년간의 실험경험과 노하우를 가지고 있습니다.
국내 많은 암 연구자분은 FFPE 샘플을 이용한 연구 위기에서 저희 나노스트링 서비스로 국 내외 많은 논문을 발행하였습니다.
샘플과 유전자가 많아 qPCR로는 엄두가 나지 않는 스크린 과정, NGS 결과를 검증하고자 하는 연구자분 모두 나노스트링의 고객이십니다.
우리는 모든 프로젝트에 고객 중심으로 접근하고, 연구자분들의 실험 설계 및 데이터 분석을 함께 하고 있습니다.

Pre-made Panel / Custom design 의 준비

* 상담을 원하시나요? 클릭하고 메일이나 연락처를 남겨주세요.

** Panel kit 종류 보고 오셨나요? 클릭하면 Pre-made Panel 정보를 확인하실 수 있습니다.

*** Panel kit 만으로 충족이 안되거나, 새로운 유전자 정보를 가지고 있다면 customized도 가능합니다.

샘플과 Panel 이 준비되면 다음과 같이 진행됩니다

step1

샘플수령

상담 후 샘플수령

step2

RNA extract & QC

조직샘플 : RNA prep 후 QC 진행
RNA샘플 : QC 진행
QC report 발행

step3

nCounter systems

D-day : hybridization
D+1 : nCounter system

step4

Data Analysis

Data QC
Annotation 정보 입력
기본 데이터 생성

step5

Report*

기본데이터 문서화
Count 데이터
Heatmap 데이터
nCounter raw files
추가 실험여부 확인
실험샘플 전달 또는 폐기

* 추가 데이터 분석은 추가 비용이 발생할 수 있습니다.

* nCounter raw files와 함께, 소프트웨어 교육 가능합니다.